AlphaFold společnosti Google DeepMind již způsobil revoluci v chápání proteinů vědci. Nyní se schopnost platformy navrhovat bezpečné a účinné léky chystá otestovat.
Isomorphic Labs, britský biotechnologický spinoff společnosti Google DeepMind, brzy zahájí pokusy na lidech s léky navrženými technologií umělé inteligence, která získala Nobelovu cenu. „Připravujeme se jít na kliniku,“ řekl prezident Isomorphic Labs Max Jaderberg 16. dubna na WIRED Health v Londýně. „Bude to velmi vzrušující okamžik, až půjdeme do klinických studií a začneme vidět účinnost těchto molekul.“
Jaderberg neupřesnil časovou osu, ale je to později, než společnost plánovala zahájit studie na lidech. Minulý rok generální ředitel Demis Hassabis řekl, že do konce roku 2025 budou mít léky navržené AI v klinických studiích.
Isomorphic Labs byla založena v roce 2021 jako vedlejší produkt dceřiné společnosti Alphabet pro výzkum AI, Google DeepMind. Společnost používá k objevování léků DeepMind AlphaFold, průkopnickou platformu AI, která předpovídá proteinové struktury.
Proteiny, složené z 20 různých aminokyselin, jsou nezbytné pro všechny živé organismy. Dlouhé řetězce aminokyselin se spojují a skládají, aby se vytvořila trojrozměrná struktura proteinu, která určuje funkci proteinu. Vědci se snažili předpovídat proteinové struktury od 70. let 20. století, ale vzhledem k astronomicky vysokému počtu možných tvarů, které může proteinový řetězec nabývat, to byl náročný proces.
To se změnilo v roce 2020, kdy Hassabis z DeepMind a John Jumper představili úžasné výsledky z AlphaFold 2, který využívá techniky hlubokého učení. O rok později společnost vydala open-source verzi AlphaFold dostupnou komukoli.
V roce 2024 vydaly DeepMind a Isomorphic Labs AlphaFold 3, který ještě více posunul vědci v chápání proteinů. Přesunul se od modelování proteinů v izolaci k předpovídání dalších důležitých molekul, jako je DNA a RNA, a jejich interakcí s proteiny.
„To je přesně to, co potřebujete k objevu léku: Musíte vidět, jak se malá molekula naváže na lék, jak silně a také na co dalšího by se mohla vázat,“ řekl tehdy Hassabis pro WIRED.
Platforma AlphaFold byla od svého vydání schopna předpovědět strukturu prakticky všech 200 milionů proteinů, které vědci znají, a použily ji více než 2 miliony lidí ze 190 zemí. Tento průlom vynesl Hassabisovi a Jumperovi Nobelovu cenu za chemii v roce 2024, přičemž Nobelova komise poznamenala, že AlphaFold umožnil řadu vědeckých aplikací, včetně lepšího pochopení odolnosti vůči antibiotikům a vytvoření obrazů enzymů, které dokážou rozkládat plasty.
Začátkem tohoto roku společnost Isomorphic Labs oznámila ještě výkonnější nástroj, který nazývá IsoDDE, svůj proprietární engine pro návrh léků. V technickém dokumentu společnost uvádí, že platforma více než zdvojnásobuje přesnost AlphaFold 3.
Startup navázal partnerství s Eli Lilly a Novartis, aby společně pracovali na objevu léků s umělou inteligencí a také rozvíjí svůj vlastní „široký a vzrušující kanál nových léků“ v onkologii a imunologii, řekl Jaderberg.
„Na molekulách, které navrhujeme, je vzrušující to, že mnohem více rozumíme tomu, jak tyto molekuly fungují, a proto jsme je zkonstruovali tak, aby byly velmi, velmi účinné,“ řekl Jaderberg publiku na WIRED Health. „Můžete je brát v mnohem nižší dávce a budou mít nižší vedlejší účinky, mimo cíl.“
Loni Isomorphic jmenoval hlavního lékaře a oznámil, že ve svém prvním kole financování získal 600 milionů dolarů na přípravu klinických studií. Mezitím společnost buduje tým klinického vývoje. Jejím posláním je „vyřešit všechny nemoci“.
„Je to šílená mise,“ řekl Jaderberg. „Ale myslíme to vážně. Říkáme to s vážnou tváří, protože věříme, že by to mělo být možné.“
Čerpáme z těchto zdrojů: google.com, science.org, newatlas.com, wired.com, pixabay.com
